水質自動監測站是以在線自動分析儀器為核心，運用現代傳感技術、自動測量技術、自動控制技術、計算機技術、通訊技術等組成的一個綜合性的水質在線自動監測系統。

傳統意義上的水質自動監測站一般有以下各系統組成：站房、采水系統、配水系統、測試系統、數據采集與傳輸系統、控制系統等。

水站的監測指標

河流上水站的標準儀器配置為五參數(水溫、pH、溶解氧、電導率、濁度)、高錳酸鹽指數和氨氮自動分析儀。湖庫上的水站在上述基礎上增加了總磷、總氮和葉綠素。在某些區域根據當地的污染特征還可以增加揮發性有機污染物(VOCs)和重金屬。在飲用水源地的水站則可以增加生物毒性和糞大腸菌群。

水站的監測頻次

國家水站每4小時采樣分析一次，每天每個監測項目可以得到6個監測結果。水站運維技術人員可以通過控制軟件自行設定監測頻次，最大監測頻次為每小時一次，全天24次。

國家水站建設的目的

國家水站的建設是為了實現環境管理部門對全國主要流域重點斷面水質狀況及其變化趨勢的實時掌控。

國家水站的選點原則

國家水站的選點原則是在重要河流的干支流省界;重要支流匯入口及入海口;重要湖庫湖體及出入湖河流;國界河流及出入境河流;重大水利工程項目周邊等。

國家水站的經費來源

國家水質自動監測網絡水站的建設與運行經費由國家財政全額撥款。